Embora a altitude média do Afeganistão seja de cerca de 1.200 m, a cordilheira Hindu Kush eleva-se a mais de 6.100 m no canto norte do panhandle de Wakhan no nordeste e continua na direcção sudoeste durante cerca de 970 km, dividindo as províncias do norte do resto do país. O Afeganistão Central, um planalto com uma altitude média de 1.800 m, contém muitos pequenos vales férteis e proporciona uma excelente pastagem para ovelhas, cabras, e camelos. Ao norte do Hindu Kush e da cordilheira central, a altitude cai para cerca de 460 m, permitindo o crescimento de algodão, frutos, grãos, nozes moídas, e outras culturas. O sudoeste do Afeganistão é um deserto, quente no Verão e frio no Inverno. Os quatro principais sistemas fluviais são o Amu Darya (Oxus) no norte, fluindo para o Mar de Aral; o Harirud e Morghab no oeste; o Helmand no sudoeste; e o Kabul no leste, fluindo para o Indo. Há poucos lagos.