AD-HIES tipicamente manifesta-se primeiro com erupção neonatal mas afecta o sistema imunitário, tecido conjuntivo, esqueleto, e desenvolvimento dentário, com variações na severidade. Eczema, abcessos cutâneos recorrentes, pneumonia com formação de pneumatocele, candidíase mucocutânea, níveis elevados de IgE sérica, e eosinofilia são as características mais comuns da imunodeficiência/desregulação. São frequentes as infecções respiratórias recorrentes graves que podem levar a uma insuficiência respiratória crónica. É descrita uma aparência facial distinta (pele áspera, assimetria facial, testa proeminente, olhos profundos, ponte nasal larga e ponta nasal carnuda, prognatismo), juntamente com anomalias da linha média. As fracturas patológicas recorrentes ocorrem em cerca de 50% dos doentes (ossos longos e costelas). A escoliose de vários graus de gravidade é observada em mais de 60%. As anomalias da dentinogénese são uma característica consistente. A reabsorção reduzida das raízes dos dentes primários pode levar a uma retenção prolongada dos dentes primários, o que por sua vez impede a erupção apropriada dos dentes permanentes. As características vasculares (aneurismas coronários e aórticos, trombose da artéria cerebelar e do canal venoso patenteado congénito) também foram relatadas. As complicações oculares podem incluir xanthelasmas, calasias gigantes, nódulos palpebrais, estrabismo, e descolamento da retina com cataratas complicadas. Há também um risco aumentado de doenças auto-imunes e linfoproliferativas.